البروتينات تتكون من جزيئات صغيرة تسمى بالأحماض الأمينية.
تبدأ عملية هضم البروتين في المعدة بواسطة الأنزيمات الهاضمة مثل حامض الهيدروكلوريك الذي يعمل على تليين المواد البروتينية لتسهيل عملية هضمها وايضا تعقيم المعدة واهم الانزيمات ايضا هو إنزيم البيبسين الي يحلل البروتينات لعديد الببتيد.